A diferencia de las anteriores reformas tributarias a las que se sometió Colombia en los años 2012 y 2014, el Proyecto de Ley que contiene la Reforma Tributaria Estructural de 2016, no contempla amnistía ó condición especial de pago alguna para los sujetos pasivos, contribuyentes, morosos o que hubiesen sido objeto de sanciones tributarias, aduaneras o cambiarias responsables de los impuestos, tasas y contribuciones.
Ni el texto del proyecto, ni la exposición de motivos contemplan texto alguno en el que se permita a los morosos ponerse al día con sus obligaciones fiscales; la Dian por su parte en publicación oficial del 21 de octubre de 2016 en la página de la entidad, informó a quienes esperaban amnistía de intereses «que cumpliendo la Sentencia C-743 de 2015 de la Corte Constitucional, el Gobierno Nacional NO incluyó ni incluirá propuesta alguna de amnistía para contribuyentes incumplidos en el pago de sus obligaciones»